《表2 高粱SPL基因家族详细信息》

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《高粱SPL基因家族的鉴定及表达分析》

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为了获得潜在的高粱SbSPL基因家族成员，我们根据已分组的拟南芥的16个SPL蛋白序列分别构建了5个隐马尔可夫模型（HMM）文件，并利用这些HMM文件去检索高粱基因组蛋白数据库sor‐ghum bicolor V3.1.1(protein＿primary），后续利用Pfam数据库对初步检索出的结果进行保守结构域的确定，从而在高粱基因组中鉴定出19个SbSPL基因，根据保守结构域的不同将其分为5组，分别为SPL＿1、SPL＿2、SPL＿3、SPL＿4和SPL＿5，并结合SbSPL基因染色体位置信息依次命名（表2）。分析发现，SbSPL蛋白等电点（pI）的范围从10.05到5.29；蛋白分子量从21.47×103到122.21×103（表2），最长的SbSPL15含有1 119个氨基酸，而最短的SbSPL4只有215个氨基酸。