《表2 三裂叶薯Itb SPL基因家族成员》

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《三裂叶薯SPL基因家族鉴定、表达及miR156的调控分析》

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利用SBP结构域检索三裂叶薯蛋白数据库，获得53个具有SBP结构域的Itb SPL基因。除去特征匹配度低和重复的序列，最终获得26个Itb SPL家族成员，其编码的基因编号为Itb SPL1～Itb SPL26（表2）。随后，利用SMART数据库和Gen Bank的CDD程序对获得的候选基因的蛋白序列进一步分析发现，26个Itb SPL全部含有完整的SBP保守结构域，其中6个Itb SPL还具有锚蛋白ANK、Spc7＿N和FAM199X结构域（图1，表2）。SBP结构域由锌指1（Zn1）、锌指2（Zn2）、连接Zn1和Zn2的联合肽（Jp）以及核定位信号（NLS）4个基序组成（图1）。Zn1（CX2CX15CX6H）和Zn2（CX4CX10-11HX5C）是Cys3His1和Cys2His Cys两种类型的锌指基序[38]。与Zn1和联合肽相比，Zn2基序中的氨基酸保守性更高。26个Itb SPL蛋白分子量从32.737 kD跨度到268.644 kD，最长的Itb SPL9含有1083个氨基酸，而最短的Itb SPL8仅有139个氨基酸，理论等电点分布在4.84～5.26之间。亚细胞预测结果显示26个Itb SPL均定位于细胞核。