《表1 柞蚕微孢子基因组LTR反转座子不同家族特征详细统计表》

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《柞蚕微孢子虫基因组LTR反转座子鉴定与进化分析》

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LTR反转座子主要编码Pol多聚蛋白来完成转座功能，该蛋白包含了多个催化结构域，其中以保守性强的RT为最重要特征。根据这一特点并结合反转座子结构的特异性，本研究在柞蚕微孢子虫基因组中鉴定到6个LTR反转座子家族，分别命名为Nar1，Nar2，Nar3，Nar4，Nar5和Nar6。其中，Nar1，Nar2，Nar3，Nar4和Nar5家族含有完整的转座子家族所具有的特征性序列即反向末端重复（Inverted terminal repeat）和靶位点重复序列（表1）。研究结果还显示:柞蚕微孢子虫LTR反转座子的长度在3～4kb之间；大部分家族的LTR末端核苷酸具有一致性，为TGT/ACA或TG/CA；但家族间的靶位点重复序列在核苷酸数量和种类上则具有差异，长度为5～6个核苷酸（表1）。此外，通过RepeatMasker软件对LTR转座子在柞蚕微孢子虫基因组上的拷贝个数进行了初步的统计，发现不同家族间拷贝子数量相差较大，其中拷贝子数量最多的为Nar3和Nar4家族，均为16个；而Nar2家族拷贝子数量最少，只有3个（表1）。