《表2 GXM14与其他微孢子虫的SSU rRNA基因序列相似性及遗传距离》
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《一株从原蚕分离的微孢子虫的生物学特性及其系统发育分析》
1:Nosema sp.GXM14;2:甜菜夜蛾微孢子虫(KT336240.1);3:家蚕微孢子虫(JF443582);4:蓖麻蚕微孢子虫(AY211392);5:家蚕微孢子虫(AB036052);6:家蚕微孢子虫(D85503);7:棉铃虫微孢子虫(FJ772435);8:云杉芽卷蛾微孢子虫(HQ457432);9:柞蚕微孢子虫(EU864526);10:山松
测序结果表明,GXM14的SSU rRNA基因序列长度1226 bp,G+C含量为34.42%;ITS序列长度503bp,G+C含量为29.82%。基于SSU rRNA基因序列,利用MEGA 5.0对GXM14及已知的6株微粒子属(No-sema)、2株钝孢虫属(Amblyospora)、3株内网虫属(Endoreticulatus)、3株变形孢虫属(Vairimorpha)、2株具褶孢虫属(Pleistophora)和3株格留虫属(Glugea)等微孢子虫构建系统发育进化树,以白僵菌(Beauveria bassiana)(EU334679)作为外群,结果(图3)发现GXM14位于Nosema属类群中,说明GXM14是Nosema属微孢子虫,与其生活史观察等传统分类结果一致。同时,采用DNASTAR中的Megalign对GXM14及13株已知微孢子虫和白僵菌的SSU rRNA基因序列进行相似性和遗传距离分析,结果(表2)发现GXM14的SSU rRNA基因序列与甜菜夜蛾微孢子虫(Nosema sp.SE)SSU rRNA基因序列(KT336240.1)的遗传距离为0.2,相似度达98.9%,说明GXM14与甜菜夜蛾微孢子虫(KT336240.1)的亲缘关系很近。此外,基于微孢子虫ITS序列的相似性和遗传距离分析结果表明,GXM14与12株已知Nosema属微孢子虫的相似度均低于91.0%,而遗传距离均在4.0以上(表3),证实GXM14是一种新的微孢子虫,故将其暂命名为Nosema sp.GXM14。
图表编号 | XD00131825500 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2020.01.01 |
作者 | 黄旭华、何强、汤庆坤、蒋满贵、李田、龙江琼、潘国庆、郑宁、鲁成、潘志新 |
绘制单位 | 广西蚕业科学研究院、西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室、广西蚕业科学研究院、广西蚕业科学研究院、西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室、西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室、西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室、西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室、西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室、广西蚕业科学研究院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |