《表2 番茄OSCAs基因家族信息》

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《番茄OSCA基因家族鉴定及不同胁迫条件下表达分析》

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利用生物信息学方法从番茄全基因组中鉴定得到12个OSCA基因家族成员，依据染色体定位信息，命名为SlOSCA1～SlOSCA12。OSCA基因家族分布于番茄12条染色体上的8条，12个基因分别位于1、2、4、6、7、8、9、12号染色体上（见图1）。2号染色体上家族基因最多，有4个，8号染色体上有2个，1、4、6、7、9和12号染色体上各1个。番茄OSCA家族基因长度、氨基酸及分子质量等理化性质分析发现（见表2），基因长度差距较大，范围2 496～12 043 bp，其中SlOSCA4基因长度最短，SlOSCA3最长。OSCA家族蛋白尺寸相差较小，大部分编码700个氨基酸，OSCA11编码氨基酸数目最少，为673个氨基酸。OSCA12编码氨基酸数目最多，为977个氨基酸。等电点最小（Sl OSCA4）为6.28，最大（SlOSCA6）为9.42，除SlOSCA4，等电点均大于7，共12个碱性蛋白。分子质量变化范围为77 062.14～110 032.77 ku，变化较大。保守结构域分析结果表明，12个OSCA蛋白均具有DUF221特征结构域。