《表4 qRT-PCR验证M1和M3组差异基因的相对表达量》

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《基于转录组学的养殖密度影响斑节对虾品质的分子机制》

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注：Ct值、Ctactin值是3次重复测定的平均值。

选择转录组测序数据中具有显著性差异和代表性的基因进行qRT-PCR验证。以M1组基因的表达水平为基准，确定M3组相应基因的相对表达量。由表4可知，相比于100尾/m2密度养殖，在300尾/m2密度养殖的斑节对虾中，神经丝重多肽、细胞色素P450 4C1、细胞色素氧化酶C亚基Ⅷ、丙酮酸脱氢酶（乙酰转移）激酶、泛素结合酶E2O、网格蛋白适配复合物、突触融合蛋白-8、微管蛋白复合物和ADP-核糖基化因子家族的相对表达量下调，其中细胞色素氧化酶C亚基Ⅷ、泛素结合酶E2O和ADP-核糖基化因子家族的相对表达量分别为0.049 3、0.048 2和0.080 9。这些基因的下调表达导致斑节对虾蛋白代谢、糖代谢、蛋白质的泛素化修饰等途径受到显著抑制，对肉品质造成负面影响。其余基因在300尾/m2密度养殖的斑节对虾中表达上调，紧密连接蛋白ZO-1在M3组的表达量是M1组的13.973 1倍，细胞色素C氧化酶集合因子2基因在M3组的相对表达量为9.049 3。