《表3 In Dels分布区间及数目统计》

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《γ射线辐射诱导水稻突变体的基因组变异分析》


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利用SAMTOOLs软件检测长度小于50 bp的小片段的插入缺失(In Dels),黄华占(WT_HHZ)/湘辐1821(MT_HHZ)一共得到142 313/147 686个I n D e l s。基因间隔区分布的I n D e l s最多,多达77 888/80 604个,其次为内含子区域有19 174/19 977个,基因上游1 kb区域有15 632/16 319个。湘辐1821外显子中的变异以移码变异为主,共有2 468个,非移码的有2 357个(表3)。基因组In Dels长度从1 bp到21 bp不等,2种基因型都是1 bp的In Dels为主要变异类型,占50%(图2)。编码区的In Dels也是1~21 bp,1 bp的In Dels在2种基因型中约占27%,2 bp的In Dels约占11%,3 bp的In Dels约占24%(图3)。在黄华占和湘辐1821中基本以短序列In Dels为主,说明点突变为主要突变方式。