《表1 通过ABAT-DELs-DEGs共表达网络发现的6个与ABAT基因共表达且相关性最强的DELs》

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《整合调控网络分析筛选骨髓增生异常综合征ABAT基因相关长链非编码RNA SET2-1及其对细胞增殖和凋亡的影响》

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基于Lnc RNA-TFs-DEGs调控网络筛选ABAT基因的调控Lnc RNA在前期的研究中，我们筛选出6个高甲基化低表达的基因（ABAT，DAPPI，FADD，LRRFIPI，PLBDI，SMPD3）并建立了MDS的Cp G岛甲基化表型，可能成为MDS诊断的潜在分子生物学标志[8]。本研究对以上6个基因进行了深入的信号通路整合分析，仅4个基因（ABAT，DAPP1，FADD和SMPD3）有功能信号通路。我们在前期研究中发现，ABAT基因异常低表达与MDS的不良预后有关，下调其表达水平可促进髓系肿瘤细胞系的增殖能力、抑制细胞凋亡，提示ABAT可能参与MDS的发生过程[9]。因此，我们在构建的MDS调控网络中，对ABAT参与的Lnc RNA-m RNA调控网络进一步分析。通过建立ABAT-DELs-DEGs共表达网络，我们发现了6个与ABAT共表达且相关性最强的DELs。根据PCC对这6个Lnc RNA进行排序发现，Lnc RNA-SET2-1与ABAT变化趋势的PCC最高（表1）。利用UCSC数据库（http：//genome.ucsc.edu）检索发现，Lnc RNA-SET2-1位于人类基因组6号染色体，为反义RNA，包括3个外显子，长度约385bp。对其进行Phylo CSF评分，确定其为非编码RNA。经DELs-DEGs共表达网络分析发现，Lnc RNA-SET2-1与ABAT、NCF2、SPTLC2、QPRT基因共表达。进一步通过Lnc RNA-mi RNA-DEGs-TFs调控网络分析和数据库信息的匹配，预测到Lnc RNA-SET2-1可能为mi RNA96的前体，而ABAT可能为mi RNA96的靶分子。根据以上生物信息学分析，Lnc RNA-SET2-1可能对ABAT具有调控作用，且参与了MDS发展过程。因此，我们进一步研究Lnc RNA-SET2-1在MDS患者及细胞系中的表达情况，及对MDS转白细胞功能的影响。