《表1 共表达基因网络：木薯中lncRNA-CRR5在低温胁迫下的功能分析》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《木薯中lncRNA-CRR5在低温胁迫下的功能分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

基于lnc RNA与邻近基因可能存在协同表达或调控关系，因此，着重分析了CRR5上下游邻近蛋白质编码基因Manes.01G155600、Manes.01G155500的表达。结果表明，二者在低温条件下表达变化不显著，因此推测CRR5和临近的上下游基因不存在共表达或调控关系。而基于基因共表达的方法，通过分析转录组中与CRR5的表达关联系数大于0.9的蛋白编码基因的功能。可以对CRR5进行功能注释。利用该方法，在木薯基因组中鉴定了29个蛋白质编码基因，它们的表达量与CRR5高度相关，将这些编码基因进行功能注释。其中29个基因参与代谢过程。6个基因与分子运输相关，15个基因参与转录调节。8个基因参与激素应答与信号转导（表1）。从而推测位于编码基因上下游的这些lnc RNA可能参与转录调节、代谢、激素应答和信号转导等生物过程来响应低温胁迫。