《表4 基因集M、N共表达网络分析节点相关度最高的节点 (前20个)》
注:基因集M,模型组比空白组的上调基因与五子衍宗丸比模型组的下调基因的103个相同基因;基因集N,模型组比空白组的下调基因与五子衍宗丸组比模型组的上调基因的407个相同基因
对基因集M、N进行共表达网络分析,9个样本聚类后,空白组、模型组、五子衍宗丸组每组的3个样本聚类,空白组与五子衍宗丸组也聚类,说明atRA干预的PC12细胞在五子衍宗丸的作用下趋向于空白组的状态,五子衍宗丸对细胞凋亡有一定抑制作用。皮尔森系数法相关系数r>0.8、节点相关度最高的20个节点如表4所示,且节点都与Ern1、Casp12、Birc5相关。我们着重关注与凋亡基因Ern1、Casp12、Birc5相关联的基因(如图5),分析得到110个基因,对这些基因做KEGG富集分析,结果包含3.3.3分析得到的“细胞周期”和“类固醇生物合成”KEGG通路。
图表编号 | XD0088542600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.02 |
作者 | 李瑞雪、樊慧杰、柴智、李艳荣、孙梦瀛、肖午帅、尉杰忠、李艳花、张波、马存根、周然 |
绘制单位 | 山西中医药大学基础医学院、山西中医药大学基础医学院、山西中医药大学基础医学院、山西中医药大学基础医学院、山西中医药大学基础医学院、山西中医药大学基础医学院、山西中医药大学基础医学院、山西中医药大学基础医学院 |
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