《表4 蛋白质互作网络中排名前20的中心节点蛋白质》

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《肝细胞癌相关差异基因的生物信息学及预后分析》

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通过STRING 10.5及Cytoscape 3.6.1软件分析，得到包含567个差异表达基因及3 095条互作关系的蛋白质相互作用网络（图1）。结果显示最大degree值为107。Degree值排名前20位的中心节点蛋白质见表4。将编码前20位中心节点蛋白质的差异基因与GO和KEGG富集得到的显著性基因取交集，得到BUB1（mitotic checkpoint serine/threonine kinase，丝裂原检查点丝氨酸/苏氨酸激酶）、BUB1B（mitotic checkpoint serine/threonine kinase B，丝裂原检查点丝氨酸/苏氨酸激酶B）、CCNA2（cyclin A2，细胞周期蛋白A2）、CCNB1（cyclin B1，细胞周期蛋白B1）、CCNB2（cyclin B2，细胞周期蛋白B2）、CDC20（cell division cycle 20，细胞分裂周期蛋白20）、CDK1（cyclin-dependent kinase1，周期蛋白依赖激酶1）、MAD2L1（mitotic arrest deficient 2 like 1）、PLK1（Polo-like kinase 1，Polo样激酶1）等9个hub genes，其相互作用网络包括36条互作关系（图2A）。KEGG分析发现hub genes主要富集在细胞周期等通路（图2B）。