《表2 IGF2BP1的共表达网络》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《m6A结合蛋白IGF2BP1在肝细胞癌中的基因调控网络分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

为了探讨IGF2BP1在HCC发生发展中的潜在作用机制，进一步预测其在HCC中的调控网络，本课题组基于TCGA数据库筛选出在HCC癌及癌旁组织中差异表达的基因（筛选标准：|log2FC|>3且P<0.001），共696个。采用Pearson法分析IGF2BP1基因与其他695个基因的共表达关系，结果发现108个基因与IGF2BP1基因的表达水平密切相关（相关系数|r|>0.3，P<0.05）。进一步通过m6Avar网站预测含有m6A修饰位点的m RNA，发现上述的108个基因中有93.5%的m RNA存在m6A位点，其中22个基因与IGF2BP1蛋白存在结合关系，见表2。分析这22个基因表达量对HCC患者总生存期的影响，结果筛选出16个m RNA与HCC预后相关，其中HMGA2等15个m RNA高表达水平可缩短患者的总生存期，而RHO的高表达可延长患者的总生存期，见图2～3。