《表1 引物序列:氟苯尼考对太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)早期发育的影响》

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《氟苯尼考对太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)早期发育的影响》


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取氟苯尼考暴露24 h后的牡蛎D型幼虫置于液氮中冷冻,于–80℃保存。使用RNA提取试剂盒(TIANGEN)提取牡蛎幼虫总RNA,利用超微量核酸蛋白检测仪(IN0311,Monad)检查RNA浓度(260 nm)和纯度(260/280 nm)。使用Evo M-MLV反转录试剂盒(AG11705,湖南艾科瑞生物工程有限公司)将RNA反转录为c DNA模板。使用Trans Start TOP Green q PCR Super Mix试剂盒(Transgen Biotech)进行荧光定量PCR(Lightcycle 96,Roche)。选择与牡蛎幼虫生长发育相关的基因,ILPR、Cg-Tyr、CYP356A1、Ferritin、HSP70、Cg-Tal和Caspase7,根据太平洋牡蛎幼虫基因组设计引物,序列如表1所示[28]。q PCR反应参数设置为:94℃预变性30 s,94℃变性30 s,退火30 s,72℃延伸60 s,共30个循环,循环完成后72℃延伸5 min。各引物序列及优化的退火温度如表1所示。选择核糖体蛋白L7(RL7)为管家基因用于标准化其他目标基因的表达水平,该基因在各处理组间未显示差异性,q RT-PCR数据采用2–ΔΔCt法进行分析。每个样品测量进行三次检测。