《表5 SNP过滤及最终位点数统计》

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《基于SLAF-Super BSA技术的玉米萌发期耐冷性定位的初步研究》

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在关联分析前，首先对任一混池中reads支持度小于3的SNP进行过滤，然后过滤与相应亲本的SNP类型差异的位点，最终得到高质量的可信SNP位点，并在此基础上识别两混池间差异的位点。过滤统计及结果见表5，使用ED算法[6]计算与目的基因连锁的区域，并通过拟合曲线确定最终关联区域（图3和图4）。由图可知，其中9号染色体出现了显著的差异峰。该染色体的结果放大如图4，取所有位点拟合值的中值加上3倍的标准差得到的阈值为0.083，可得到定位区域为1 923 152.00～92 980 413.00bp(91 057 262.00bp）。