《表1 M.oxyfera-like的PCR扩增引物及条件》
常用的M.oxyfera 16S r RNA基因巢式PCR引物对为202F/1545R和q P1F/q P2R[22]。以此菌专属的pmo A为目标基因设计的巢式PCR引物对为A189_b/cmo682和cmo182/cmo568[15]。基于nod功能基因设计的PCR引物对为nod684Fv2/nod1706Rv2[31]。对于M.oxyfera丰度的研究目前还没有成熟的专属pmo A功能基因的定量PCR引物,仅有少数自然生境成功使用这一功能基因进行定量(如漳江河口[32]引物对cmo182/cmo568、香港大榄涌水塘[33]引物对HP3F1/HP3R1等)。对于功能基因nod的定量,常选用nod1446F/nod1706Rv2作为引物[31]。大部分定量研究利用该菌16S r RNA基因进行,常用的定量PCR引物对有q P1F/q P1R[22]、q P2F/q P2R[22]、q P1F/q P2R[11]、q P1m F/q P1R[34],表1整理了已发表的各种扩增引物及退火温度。
图表编号 | XD00197496700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.11.20 |
作者 | 赵子闻、李佳、侯俊青、赵曼平、赵吉、武琳慧 |
绘制单位 | 内蒙古大学生态与环境学院、内蒙古大学生态与环境学院、内蒙古大学生态与环境学院、内蒙古大学生态与环境学院、内蒙古大学生态与环境学院、内蒙古自治区环境污染控制与废物资源化重点实验室、内蒙古大学生态与环境学院、内蒙古自治区环境污染控制与废物资源化重点实验室 |
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