《表1 M.oxyfera-like的PCR扩增引物及条件》

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《自然生境中亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化细菌研究进展》


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常用的M.oxyfera 16S r RNA基因巢式PCR引物对为202F/1545R和q P1F/q P2R[22]。以此菌专属的pmo A为目标基因设计的巢式PCR引物对为A189_b/cmo682和cmo182/cmo568[15]。基于nod功能基因设计的PCR引物对为nod684Fv2/nod1706Rv2[31]。对于M.oxyfera丰度的研究目前还没有成熟的专属pmo A功能基因的定量PCR引物,仅有少数自然生境成功使用这一功能基因进行定量(如漳江河口[32]引物对cmo182/cmo568、香港大榄涌水塘[33]引物对HP3F1/HP3R1等)。对于功能基因nod的定量,常选用nod1446F/nod1706Rv2作为引物[31]。大部分定量研究利用该菌16S r RNA基因进行,常用的定量PCR引物对有q P1F/q P1R[22]、q P2F/q P2R[22]、q P1F/q P2R[11]、q P1m F/q P1R[34],表1整理了已发表的各种扩增引物及退火温度。