《表3 用于PCR扩增的r DNA引物序列及反应条件》
硅胶干燥的子实体经烘箱45℃烘干后采用改进的CTAB法提取总DNA(Doyle,1987),用分光光度计NanoDrop 2000(Thermo Scientific)逐一测量每个样品的DNA质量与浓度,依据浓度将所有样品均稀释到10 ng/uL左右,利用ITS、IGS、LSU 3个片段引物对黄绿卷毛菇样品进行扩增,涉及到的引物和PCR反应条件已说明(表3)。扩增产物1%琼脂糖凝胶电泳检测。PCR程序为95℃变性5 min、不同引物的不同退火温度30 s、72℃延伸30 s(LSU 60 s),进行35个循环,最后72℃延伸10 min。PCR反应使用15μL体系,包括30 ng全基因组DNA、200 mmol/L 10×PCR Buffer、1.5 mmol/L Mg Cl2、0.2 mmol/Ld NTPs、200 nmol/L各引物,以及1 U的Taq DNA酶。所有PCR扩增的产物用CASpure PCR Purification Kit试剂盒(上海中科开瑞生物芯片科技股份有限公司)按照说明书进行纯化。纯化产物用BigDye v3.1(Applied Biosystems)进行测序PCR,引物使用与PCR扩增是相同的。测序PCR的扩增产物按照操作说明进行纯化,然后利用ABI 3730 xl(Applied Biosystems,USA)进行测序分析。
图表编号 | XD0062465700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.25 |
作者 | 邢睿、徐明行、王久利、陈世龙 |
绘制单位 | 中国科学院高原生物适应与进化重点实验室、青海省作物分子育种重点实验室、青海大学生态环境工程学院、中国科学院高原生物适应与进化重点实验室、中国科学院大学、中国科学院高原生物适应与进化重点实验室 |
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