《表1 灭菌水和GB03挥发性有机物处理下拟南芥根部转录组测序数据统计》

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《根际益生菌挥发性有机物对拟南芥根部基因表达的影响分析》

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为了全面探索表达受到解淀粉芽孢杆菌GB03挥发性有机物影响的拟南芥功能基因，提取受到GB03挥发性有机物处理48 h拟南芥根的RNA用于全转录组去rRNA测序（对照和GB03挥发性有机物处理分别进行3个生物学重复，共6个拟南芥根部测序样品）。通过测序样品获得总共324938098个raw reads，平均每个样本54 156 349个raw reads。质量控制去除低质量碱基和序列后，获得306 594 728 clean reads，为raw reads的94.35%（表1）。与拟南芥TAIR10参考基因组进行比对，结果表明，6个测序样本的clean reads，平均94.28%可以比对到基因组的单一位置（表2），说明转录组测序质量较高，可以用于后续分析。