《表4 候选序列扩测条件优化》
利用MEGA 7.0软件对PsbA-trnH序列比对分析,去重复序列发现,百两金的PsbA-trnH序列长度较朱砂根少56 bp (表4),分别为5'端缺少7 bp、248位点至293位点为空缺、3'端缺少4 bp。百两金PsbA-trnH序列(BL1~BL29)共29条,比对后长度为439 bp,共77个变异位点,其中序列信息位点有71个,GC含量为28.5%。朱砂根PsbA-trnH序列(ZS1,ZS2),比对后长度495 bp,共有2个变异位点,分别为174位点的胸腺嘧啶-鸟嘌呤(T-G)的变异、420位点腺嘌呤-胸腺嘧啶(A-T)的变异,GC含量为29.5%。红凉伞PsbA-trnH序列(HL1)无变异,GC含量为29.7%。若将百两金较朱砂根所缺少的位点作缺失处理,进行序列比对后,将两者信息位点相互比较,其中存在百两金特征信息位点,如392 bp处的A。但多数信息位点有交叉现象,如在297位点,朱砂根为G,百两金则有G、T;302 bp处,朱砂根为A,百两金则有A、T;396 bp处,朱砂根C,百两金则有C、T等。基于八爪金龙PsbA-trnH序列的NJ树结果(图3),红凉伞与朱砂根被聚成独立的支,百两金有与同属近缘类似品混聚。
图表编号 | XD00194390800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.28 |
作者 | 潘婕、刘畅、俸婷婷、刘雄伟、周永强、石慧、周英 |
绘制单位 | 贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州大学贵州省药食同源植物资源开发工程技术研究中心、贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州中医药大学 |
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