《表1 不同DNA条形码序列的评估》
从百两金、朱砂根和红凉伞中获得ITS2、ITS、RbcL和PsbA-trnH序列。比较分析各候选序列PCR扩增成功率、测序成功率、变异位点等信息(表1)。ITS2、RbcL和ITS序列的PCR成功率及测序成功率均达到100%,PsbA-trnH序列稍低。在利用NCBI中Blast程序对所得序列进行序列比对,初步确定物种基原时,ITS2和ITS序列比对率最高,其次是PsbA-trnH序列,RbcL序列的BLAST效率最低,不利于后续的建NJ树分析。PsbA-trnH在5个候选序列中变异位点最多。综合以上结果,鉴定成功率依次为ITS>PsbA-trnH>ITS2>RbcL。
图表编号 | XD00194390900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.28 |
作者 | 潘婕、刘畅、俸婷婷、刘雄伟、周永强、石慧、周英 |
绘制单位 | 贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州大学贵州省药食同源植物资源开发工程技术研究中心、贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州中医药大学 |
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