《表1 不同DNA条形码序列的评估》

《表1 不同DNA条形码序列的评估》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《苗药八爪金龙基原植物DNA条型码的筛选与鉴定》


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从百两金、朱砂根和红凉伞中获得ITS2、ITS、RbcL和PsbA-trnH序列。比较分析各候选序列PCR扩增成功率、测序成功率、变异位点等信息(表1)。ITS2、RbcL和ITS序列的PCR成功率及测序成功率均达到100%,PsbA-trnH序列稍低。在利用NCBI中Blast程序对所得序列进行序列比对,初步确定物种基原时,ITS2和ITS序列比对率最高,其次是PsbA-trnH序列,RbcL序列的BLAST效率最低,不利于后续的建NJ树分析。PsbA-trnH在5个候选序列中变异位点最多。综合以上结果,鉴定成功率依次为ITS>PsbA-trnH>ITS2>RbcL。