《表2 相关性:蜂窝状数字PCR微阵列荧光图像的信息提取》

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《蜂窝状数字PCR微阵列荧光图像的信息提取》


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如图10所示,在芯片中间区域随机选取了1 000片方形碎片,每块碎片都包含约20个样点,使用AHMAA算法取得每个样点的位置信息,计算得出这20个点与点之间的欧式距离。在这样的小碎片中,点与点之间大约有24种不同的距离。其中,相邻点之间的距离最短,对角线两端两个点之间的距离最长。本文计算统计了所有的距离,然后将这1 000块碎片的相同距离的数据放在一起,计算每种距离的CV值。最后得出结果,CV值最大的是相邻点之间的距离,为2.69%,间隔一个点之间的距离CV值为1.43%,随着距离的增大,CV值逐渐减小。图10(b)是截取的前10组距离的CV值。为了验证最终采集数据的准确性,本文对5张数字PCR芯片样品,分别使用标准仪器系统软件和本实验室自行研制的图像采集系统及AHMAA算法处理,得到有效填孔数与拷贝数,结果如表1~表2所示。这5张芯片中,编号为C0HGWS、C0HS51的只含有FAM染料,编号为C0HY06的只含有VIC染料,编号为C0HUN8、C0I6MQ的是同时含有FAM与VIC染料的芯片。与标准仪器的结果相比,通过AHMAA算法处理得出的有效填孔数目结果的误差率在0.35%~3.03%,平均相差1.208%,准确率达到98.792%;计算得到的拷贝数与之相比,误差率在0.57%~8.31%,平均误差率为3.8%,准确率达到96.2%。