《表1 基因组SSR检索》

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《基于灯盏花全基因组SSR位点分析及多态性引物开发》


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灯盏花基因组组装的462 622条scaffolds,序列总长度为1 217 085 526 bp,其中包含SSR的序列数为72 673条,发生频率为15.71%。检测到231 852个SSR位点,含一个以上SSR位点的scaffolds有30 144条,复合SSR有37 038个。灯盏花基因组中,就SSR分布情况来说,平均每5.25 kb含有一个SSR位点(表1)。