《表2 灯盏花SSRs分布》
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《基于灯盏花全基因组SSR位点分析及多态性引物开发》
注:Mono-,di-,tri-,tetra-,penta-和hexa-分别表示单核苷酸,二核苷酸,三核苷酸,四核苷酸,五核苷酸和六核苷酸Note:Mono-,di-,tri-,tetra-,penta-and hexa-represented mono-,di-,tri-,tetra-,penta-and hexa-nucleotide,respectively
对灯盏花基因组SSR进行统计分析,就核苷酸重复基元来看,灯盏花基因组SSR种类丰富,一至六核苷酸重复基序都能找到,其中二核苷酸重复基序为灯盏花基因组中最为丰富的类型,有109 285个位点,占总数的47.14%,其次是二核苷酸重复基序及三核苷酸重复基序,分别有75 852和38 391,占比分别为32.72%和16.56%。四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复基序占比数目较少,分别为1.18%、1.33%和1.08%。从核苷酸的重复次数来看,核苷酸重复基元以重复六次最为常见,有50 104个位点,占总数的21.61%;重复七次(11.47%)、五次(11.11%)和十二次(10.88%)的核苷酸较为常见(表2)。
图表编号 | XD0019088300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.06.28 |
作者 | 刘松卫、卢迎春、宋婉玲、韦坤华、杨生超、张广辉 |
绘制单位 | 云南农业大学西南中药材种质创新与利用国家地方联合工程研究中心、云南农业大学西南中药材种质创新与利用国家地方联合工程研究中心、云南农业大学西南中药材种质创新与利用国家地方联合工程研究中心、广西壮族自治区药用植物园广西药用植物保护与遗传改良重点实验室、云南农业大学西南中药材种质创新与利用国家地方联合工程研究中心、云南农业大学西南中药材种质创新与利用国家地方联合工程研究中心 |
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