《表3 图1所对应的模块1的富集通路及节点基因》
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《皮肤鳞状细胞癌的基因表达及信号传导通路的生物信息学分析》
注:FDR为错误发现率。
基于STRING数据库筛选出10个最具代表性的枢纽节点如下:Src homology 2domaincontaining transforming protein 1(SHC1)、Aurora kinase B(AURKB)、structural maintenance of chromosomes 4(SMC4)、Pololike kinase1(PLK1)、proliferating cell nuclear antigen(PCNA)、Pituitary tumortransforming gene 1(PTTG1)、Breast cancer 1(BRCA1)、Minichromosome Maintenance Deficient 2(MCM2)、EPH receptor B2(EphB2)、Histone deacetylase(HDAC)。应用MCODE软件对蛋白质PPI网络进行分析,筛选出3种最显著的PPI模型,见图1。富集分析显示,3种PPI模型中的基因与DNA复制、蛋白酶体、细胞周期信号通路有密切联系。见表3~5。
图表编号 | XD00188195500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.04.25 |
作者 | 陆晓鸥、宗兴燕、王璐、陈宏泉 |
绘制单位 | 青岛大学附属医院皮肤科、青岛大学附属医院皮肤科、青岛大学附属医院皮肤科、青岛大学附属医院皮肤科 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |