《表3 共同差异基因的KEGG通路富集结果》

《表3 共同差异基因的KEGG通路富集结果》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《特发性与继发性肺动脉高压基因表达差异的生物信息学证据》


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基于以上对两类PAH的DEGs的筛选与分析,我们通过绘制韦恩图得到二者的共同差异基因。在本研究中,IPAH与CHD-PAH共有357个共同差异基因(图5A)。值得注意的是,这些共同差异基因在IPAH与CHD-PAH中具有相反的表达趋势,即有42个基因在IPAH中呈上调趋势,而在CHD-PAH中呈下调趋势,剩余315个基因的表达情况则相反。GO富集分析结果见图5C,共同差异基因在核质、poly(A)RNA结合、核仁和膜等方面显著富集。KEGG通路富集分析显示,共同差异基因主要富集在真核生物中核糖体生物发生、肌动蛋白细胞骨架的调节、RNA转运、RNA降解和血管平滑肌收缩五条信号通路中(表3)。此外,对共同差异基因构建的PPI网络进行分析,得到该网络中最显著的模块(图5B),该模块在核糖体生物发生中发挥作用。该网络中筛选得到前10位关键基因依次为CDC5L,EPRS1,MTREX,HSP90AA1,POLR2B,PUM3,SMC3,ATRX,DDX21和DDX18,各基因的功能描述见表4。