《表4 共同富集KEGG与干旱相关通路基因功能注释》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《DNA甲基化参与调控马铃薯响应干旱胁迫的关键基因挖掘》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

为了进一步分析DNA甲基化参与调控马铃薯干旱胁迫响应的相关基因的生物学功能，利用KEGG数据库对2个马铃薯品种在甘露醇和DNA甲基化抑制剂处理下共同差异表达的基因进行通路分析发现，1345个差异表达基因显著富集到12个KEGG pathways （图4-A），其中与植物抗旱相关的通路有5个，分别是植物MAPK信号通路（KO04016，富集到DEG有11个）、谷胱甘肽代谢（KO00480，富集到DEG有8个）、糖酵解/糖异生（KO00010，富集到DEG有8个）、磷酸肌醇代谢（KO00562，富集到DEG有5个）、植物激素信号转导通路（KO04075，富集到DEG有14个）。通过pathview绘制富集通路的基因在干旱和去甲基化处理下的表达模式和调控网络发现，大西洋和青薯9号在响应干旱处理和DNA去甲基化处理下，谷胱甘肽代谢（图4-B）和磷酸肌醇代谢（图4-C）通路中差异基因多为上调表达基因，且2种处理下各时间点表达趋势类似。而MAPK信号（图4-D）、糖酵解/糖异生代谢（图4-E）和植物激素信号转导（图4-F）通路中差异基因多为下调表达基因。这些基因的功能注释信息如表4所示。