《表1 hMeDIP-PCR引物》
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《根尖牙乳头干细胞调控Foxp3位点去甲基化促进CD4~+T细胞向调节性T细胞转化的研究》
收集各组CD4+T细胞,按照DNA提取试剂盒说明书提取基因组DNA并定量;每组各取1μg DNA,进行超声波打断,使DNA片段化,琼脂糖凝胶电泳验证片段长度,介于200~600 bp之间方可进行后续实验;每组各取1μg片段化DNA(记为input DNA),此外预留100 ng DNA(记为10%input DNA)待用;以input DNA作为样本,加入4μL 5hmC抗体以结合含有5hmC的DNA片段,4℃孵育过夜;加入20μL蛋白质G磁珠,室温孵育2 h,收集磁珠并加入洗脱液,将与5hmC抗体、磁珠结合的DNA片段洗脱(记为5hmC DNA),随后将两组中富集所得的5hmC DNA与预留的10%input DNA同时进行DNA纯化并定量,纯化步骤按照DNA纯化试剂盒说明书进行。设计合成Foxp3位点启动子区、CNS2区引物(表1),分别以纯化后各组10%input DNA、5hmC DNA作为模板,采用RT-qPCR技术进行扩增,随后按照相对定量的方法对每组富集所得5hmC DNA片段量进行定量并比较,计算公式为:5hmC相对表达量=10%×2[CT(10%input DNA)-CT(5hmC DNA)]。
图表编号 | XD00181143400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.15 |
作者 | 李羽思、余思、刘雪梅、陈旭 |
绘制单位 | 中国医科大学口腔医学院·附属口腔医院儿童口腔科辽宁省口腔疾病重点实验室、中国医科大学口腔医学院·附属口腔医院儿童口腔科辽宁省口腔疾病重点实验室、中国医科大学口腔医学院·附属口腔医院儿童口腔科辽宁省口腔疾病重点实验室、中国医科大学口腔医学院·附属口腔医院儿童口腔科辽宁省口腔疾病重点实验室 |
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