《表3 PCR循环条件:衰老细胞染色质开放变化的初步分析》
参照文献[16]的方法,对2BS细胞进行Tn5酶切反应,主要步骤如下:取冻存于液氮中的PD26、PD55的2BS细胞进行复苏。复苏后的细胞置于T75培养瓶,采用添加10%胎牛血清、1%青霉素链霉素混合液的1640培养基培养,培养箱条件为37℃、5%CO2。当细胞长满且生长状态良好时,用胰酶将细胞消化,并使用台盼蓝染色,过滤除去死细胞后进行细胞计数,计数50 000个细胞。取计数后的细胞,在4℃条件下500 g离心5 min后弃上清;再加入50μL预冷PBS吹打洗涤,4℃条件下500 g离心5 min,弃上清;加入50μL预冷的裂解液(由10 mmol/L Tris pH 7.5、10 mmol/L NaCl、3 mmol/L MgCl2以及0.1%NP-40配置而成)悬浮细胞,在4℃条件下500 g离心10 min后弃上清。此时向细胞沉淀中加入50μL转座反应体系(表1),吹打混匀后,37℃孵育30 min。待孵育结束后使用DNA纯化试剂盒纯化DNA,纯化完成后使用10μL试剂盒中的洗脱液将其洗脱,随后进行PCR扩增。PCR反应体系如表2所示,循环条件见表3。其中,PD26对应的primer 1序列为AGGCAGAA,PD55对应的primer 1序列为TCCTGAGC;barcoded primer 2序列为AATGAT-ACGGCGACCACCGAGATCTACACTCGTCGGCA-GCGTCAGATGTG。PCR结束后,再次使用DNA纯化试剂盒纯化DNA[17]。
图表编号 | XD00170760600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.30 |
作者 | 宋乔、王亚琦、侯玉丽、刘静、张晓敏、曹敏、王培昌 |
绘制单位 | 首都医科大学宣武医院检验科、首都医科大学宣武医院检验科、首都医科大学宣武医院检验科、首都医科大学宣武医院检验科、首都医科大学宣武医院检验科、首都医科大学宣武医院检验科、首都医科大学宣武医院检验科 |
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