《表2 部分ESTs与已知基因的同源性比较》

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《眼斑芫菁在斑蝥素合成期的抑制性消减杂交文库构建及分析》


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对文库中的285个差异表达克隆进行测序分析.利用DNAStar和PHRAP软件对EST序列去除载体序列和接头序列,聚类分析、数据拼接,共拼接成130条ESTs,其中72条singletons,58条contigs,将处理后的ESTs提交到Genbank进行blastn比对.在130条ESTs中,34条(26%)与假设蛋白质基因有同源性;51条(39%)与已知功能蛋白基因有同源性;而剩下的45条(35%)与数据库中的序列没有发现同源性,可能代表了新的未知功能基因(图3).对51条己知功能的同源ESTs进行功能分析,这些基因涉及多种代谢和应答过程,如生物调控、应激反应和解毒、信号转导、代谢和合成等(表2).所有ESTs提交到NCBI中的db EST数据库,序列号为JZ139169-JZ139298.