《表2 HvNud与燕麦同源基因AsNud的同源性》
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《燕麦籽粒皮裸性相关AP2/ERF转录因子基因的克隆》
通过对AsNud基因序列特征进行分析,研究AsNud基因序列的遗传多样性,结果显示(表2),CIav2921AsNud1基因组的DNA长度为744 bp、CIav9008AsNud1基因组为744 bp、HvNud为884 bp;CIav2921AsNud1开放阅读框(ORF)长度为48 bp、CIav9008AsNud1开放阅读框为639 bp、HvNud为684 bp;CIav2921AsNud1预测的基因产物包含15个氨基酸残基,CIav9008AsNud1为212个氨基酸、HvNud为227个氨基酸;CIav2921AsNud1估计分子质量为1.9 ku、CIav9008AsNud1为22.8 ku、HvNud为24.1 ku;CIav2921AsNud1等电点为12.83、CIav9008AsNud1为10.03、HvNud为9.74。CIav2921AsNud1 ORF的GC含量(54.17%)低于大麦HvNud ORF(65.64%)及全基因组DNA(61.20%),CIav9008AsNud1 ORF的GC含量(61.19%)低于大麦HvNud ORF(65.64%)及大麦基因组DNA(61.20%)。CIav2921AsNud1与大麦HvNud在基因组DNA中核苷酸相似性为65.64%,而在ORF与肽水平上,相似性分别为6.14%和6.17%;CIav9008AsNud1与大麦HvNud在基因组DNA、ORF与肽水平上,其相似性分别为71.37%、73.68%和69.60%。
图表编号 | XD00171664400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.20 |
作者 | 张鸣凡、陈志伟、贾举庆、张晓军、李欣、张春来、张美俊、杨武德 |
绘制单位 | 山西农业大学农学院、山西农业大学农学院、山西农业大学农学院、山西省农业科学院作物科学研究所作物遗传与分子改良山西省重点实验室农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室、山西省农业科学院作物科学研究所作物遗传与分子改良山西省重点实验室农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室、山西农业大学农学院、山西农业大学农学院、山西农业大学农学院 |
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