《表2 HvNud与燕麦同源基因AsNud的同源性》

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《燕麦籽粒皮裸性相关AP2/ERF转录因子基因的克隆》


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通过对AsNud基因序列特征进行分析,研究AsNud基因序列的遗传多样性,结果显示(表2),CIav2921AsNud1基因组的DNA长度为744 bp、CIav9008AsNud1基因组为744 bp、HvNud为884 bp;CIav2921AsNud1开放阅读框(ORF)长度为48 bp、CIav9008AsNud1开放阅读框为639 bp、HvNud为684 bp;CIav2921AsNud1预测的基因产物包含15个氨基酸残基,CIav9008AsNud1为212个氨基酸、HvNud为227个氨基酸;CIav2921AsNud1估计分子质量为1.9 ku、CIav9008AsNud1为22.8 ku、HvNud为24.1 ku;CIav2921AsNud1等电点为12.83、CIav9008AsNud1为10.03、HvNud为9.74。CIav2921AsNud1 ORF的GC含量(54.17%)低于大麦HvNud ORF(65.64%)及全基因组DNA(61.20%),CIav9008AsNud1 ORF的GC含量(61.19%)低于大麦HvNud ORF(65.64%)及大麦基因组DNA(61.20%)。CIav2921AsNud1与大麦HvNud在基因组DNA中核苷酸相似性为65.64%,而在ORF与肽水平上,相似性分别为6.14%和6.17%;CIav9008AsNud1与大麦HvNud在基因组DNA、ORF与肽水平上,其相似性分别为71.37%、73.68%和69.60%。