《表2 MDV YL2002 meq基因的同源性》

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《广西玉林地区MDV强毒YL2002株的分离鉴定》


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1:814;2:648A;3:CVI988;4:CC1409;5:GXY2;6:GX0101;7:G2;8:LMS;9:Md5;10:JS201801;11:SD2012-1;12:WC1203;13:HNGS101;14:YL2002;15:RB-1B;16:JL1404.

YL2002分离株meq基因的Gen Bank登录号为MW196443,核苷酸长度为1 020 bp,用DNAStar软件中的Megalign组件和MEGA X软件对国内外15株MDV参考序列进行比对。同源性比较结果显示(表2),MDV YL2002分离株与国内分离株JS201801株的同源性最高(100%),与国外参考毒株648A的同源性最低(98.4%)。系统进化树结果见图5。YL2002分离株Meq基因与国内近年来的分离株位于同一分支。其meq基因的ORF共编码339个氨基酸,不存在基因片段的插入或缺失,存在氨基酸的突变。与国内大部分分离株相似的是,YL2002株氨基酸突变位点分别出现在第71、77、80、115、139、176、217位,其对应位点的氨基酸分别为A、E、Y、A、A、R、A。不同的是YL2002株于第88位和第93位的氨基酸突变为苏氨酸T和R精氨酸(表3)。这两个点位的突变只与JS201801株相同,符合近年新出现的meq基因氨基酸突变规律。