《表1 用于ABCC8基因突变分析的PCR引物和条件》
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《4例先天性高胰岛素血症患儿ABCC8基因突变分析》
分析针对ABCC8基因(NM_000352)的39个外显子及KCNJ11基因(NM_000525)的一个外显子,采用Primer Premier 3.0设计引物,扩增全部外显子以及与外显子交界的部分内含子区域(表1、表2)。PCR反应体系为50μL:TaKaRa LA Taq premix 25μL,上、下游引物各1μL(10 pmol/μL),基因组DNA 100 ng,加去离子水至50μL。PCR反应条件:95℃预变性5 min;95℃变性30 s,60~62℃退火30 s,72℃延伸1 mim,35个循环;72℃延伸10 min。PCR产物经1.5%琼脂糖凝胶电泳鉴定。PCR扩增产物送英骏生物公司测序,结果与人类基因组ABCC8基因序列进行比较。通过仔细比对人类遗传疾病突变数据库HGMD(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)、ClinVar(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/)和dbSNP(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP),确定变异是否为新生突变。采用生物信息学软件PolyPhen 2.0、SIFT和Mutation Taster对新生变异的有害性进行预测,并根据美国医学遗传学与基因组学学会发布的标准和指南(ACMG/AMP)对变异进行分类[10]。
图表编号 | XD00156869600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.30 |
作者 | 何敏、吕福通、孙燕、柳青、刘凤琼、华荣 |
绘制单位 | 广西壮族自治区生殖医院、广西壮族自治区生殖医院、广西壮族自治区生殖医院、广西壮族自治区生殖医院、广西壮族自治区生殖医院、广西壮族自治区生殖医院 |
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