《表4 4个突变的生物信息学分析》
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《4例先天性高胰岛素血症患儿ABCC8基因突变分析》
PolyPhen-2分类:有害,可能有害,良性;SIFT分类:有害,良性;MutationTaster分类:致病,多态;a脊椎动物间保守性:0是,所有的脊椎动物间比对,80%以上都一样;不否,在所有比对的脊椎动物间比对,不到80%;ACMG变异分类:致病,可能致病,临床意义不明,可能良性和良性。
对4例患儿ABCC8/KCNJ11基因进行检测,其中KCNJ11未检测到变异,ABCC8基因共检测出5种突变,分别为c.382G>A(p.Glu128Lys)、c.331G>A(p.Gly111Arg)和c.4374G>C(p.Gln1458His),c.698T>C(p.Met233Thr)和c.4213G>A(p.Asp1405Asn),见图1。其中c.698T>C(p.Met233Thr)在HGMD(http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/)人类突变数据库以及ClinVar数据库中未见收录,SNP数据库无这个突变记录。家系验证表明,c.382G>A(p.Glu128Lys)来源于患儿1的父亲,c.331G>A(p Gly111Arg),c.4374G>C(p.Gln1458His)为新发变异,患儿2和3的父母均未携带此变异。c.698T>C(p.Met233Thr)为新的变异,来源于患儿4的父母,对这个变异进行保守性分析,这个位点在多物种间高度保守(图2)。Mutationtaster、PolyPhen-2和SIFT软件预测,这些变异均为有害性变异(表4)。依据ACMG/AMP对变异的致病性进行评估,这个变异被评估为可能致病性变异。
图表编号 | XD00156869300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.30 |
作者 | 何敏、吕福通、孙燕、柳青、刘凤琼、华荣 |
绘制单位 | 广西壮族自治区生殖医院、广西壮族自治区生殖医院、广西壮族自治区生殖医院、广西壮族自治区生殖医院、广西壮族自治区生殖医院、广西壮族自治区生殖医院 |
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