《表1 赤霞珠果实苹果酸生物合成关键基因的筛选》
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《酿酒葡萄赤霞珠果实苹果酸生物合成关键基因的功能鉴定》
注:基因编号为二代测序以黑比诺葡萄品种为参考基因组,经拼接组装的编号
赤霞珠果实转录组二代测序结果分析显示,以黑比诺(Pinot Noir)酿酒葡萄品种为参考基因组,经拼接组装,样本平均获得13 850 473条原始读序,20 120条基因序列,高质量的原始读序平均达97.78%;三代测序结果分析显示,样本平均获得49 753条原始读序,30 039 260个碱基序列,平均长度为2 089 bp,质量值平均达0.89。根据转录组二代和三代测序后的注释结果,筛选出与赤霞珠果实苹果酸生物合成比较密切的8种相关酶类的同源基因,其中丙酮酸激酶(pyruvate kinase,PK)17个基因、丙酮酸脱氢酶(pyruvate dehydrogenase,PDH)13个基因、磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvatecarboxylase,PEPC)5个基因、丙酮酸羧化酶(pyruvate carboxylase,PC)5个基因、柠檬酸合酶(citrate synthase,CS)4个基因、顺乌头酸酶(aconitase,ACO)3个基因、延胡索酸水化酶(fumarate hydratase,FH)3个基因和苹果酸脱氢酶(malate dehydrogenase,MDH)11个基因(表1)。
图表编号 | XD00156636200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.25 |
作者 | 林哲、赵帅、袁春春、路国栋、陈任 |
绘制单位 | 宁夏大学宁夏优势特色作物现代分子育种重点实验室、宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室、宁夏大学生命科学学院、宁夏大学宁夏优势特色作物现代分子育种重点实验室、宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室、宁夏大学生命科学学院、宁夏大学宁夏优势特色作物现代分子育种重点实验室、宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室、宁夏大学生命科学学院、宁夏大学宁夏优势特色作物现代分子育种重点实验室、宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室、宁夏大学生命科学学院、宁夏大学宁夏优势特色作 |
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