《表2 CNCI软件预测到的lncRNAs》

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《广藿香长链非编码RNA分析》

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CNCI（Coding-non-coding index）是中科院计算所赵屹团队开发的一款从转录组中分析编码RNA和非编码RNA的软件，通过分析相邻核苷酸三联体特征来鉴定编码-非编码转录本的方法（Sun et al.，2013）。该软件不依赖于已知的注释文件，能够对不完整的转录本和反义转录本对进行预测。CNCI软件预测得到7 988个lncRNAs（表2），序列最短为280 nt，最长为10 850 nt。主要集中在长度为280～4 000 nt的范围，达到总量的99.512%。总的长度与数量关系是序列越长，lncRNAs数量越少。