《表2 SPCR预测每对引物能够检测到的包含merA基因的细菌种类及数目》

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《细菌汞抗性基因merA特异性的3对PCR引物的检测范围的比较》


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注:N/A:根据SPCR预测,引物对没有检测到属于相应细菌的merA基因序列;后面括号内的数字代表总序列;(0.8):产物扩增系数为0.8,原文献推荐值;(0.9):产物扩增系数为0.9,相当于更严谨的PCR条件下;字体加粗:在扩增系数为0.9时,每对引物扩增的序列数占相应细菌总序列数的比例

从NCBI的RefSeq参考序列数据库中(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/)下载了118条merA基因序列,与在UniProtKB数据库的Swiss-Prot库中以及BacMet库中下载的所有经过实验验证的18条merA基因序列合并,去除冗余序列,得到共计136条(23个属)非冗余merA基因序列。将这136条序列作为模板,导入SPCR程序中(Cao et al.,2005),模拟预测merA2F/merA2R,merAf/merAr和A1s-n.F/A5-n.R3对引物分别能够检测的merA基因的数目及细菌种类(表2)。