《表1 CPAT软件预测到的lncRNAs》

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《广藿香长链非编码RNA分析》

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CPAT（Coding potential assessment tool）分析从大量候选转录本中快速识别编码和非编码转录本（Wang et al.，2013）。它是基于开放阅读框（open reading frame，ORF）大小、ORF覆盖度、Fickett得分和六联体使用偏倚构建的逻辑回归模型。使用CPAT软件预测得到22 233个lncRNAs（表1），序列最短为280 nt，最长为8 967 nt。主要集中在长度为280～4 000 nt的范围，达到总量的99.038%。随着序列的长度增加，lncRNAs数量减少。