《表3 CPC软件预测到的lncRNAs》

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《广藿香长链非编码RNA分析》

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CPC（Coding potential calculator）是最早的从转录组中分析lncRNA的软件。它基于序列比对，把未知转录本和已知蛋白数据库对比，从而筛选出编码和非编码的转录本。CPC根据转录本各个编码框的生物学序列特征评估其编码潜能（Kong et al.，2007）。以全部Unigenes为基础数据，CPC软件预测到的lncRNAs统计结果如下（表3），共计得到10 107个lncRNAs，最短为280 nt，最长为8 967 nt。主要集中在长度为280～4 000 nt，这个长度范围的lncRNAs占到总数的99.446%。