《表1 引物和探针序列:寨卡病毒RNA恒温快速扩增检测方法的建立》

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《寨卡病毒RNA恒温快速扩增检测方法的建立》


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通过Bioedit Sequence Alignment Editor软件对序列进行比对,选取ZIKV NS1片段保守区作为引物、探针设计的候选序列,依据设计原则,设计上、下游引物各5条,以及3条探针进行,用ZIKA体外转录RNA作为模板进行第一轮筛选,确立了最佳探针和3个候选上下游引物。依据引物筛选策略,将候选引物碱基位置及数量做进一步调整,经设计软件比对分析又设计5条上游引物和3条下游引物进行第二轮筛选,确定了检测效果较好的引物,引物探针序列详见表1。