《表2 scFv各序列的相关特征》

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《抗H3N2亚型犬流感病毒重组犬源化抗体的制备及特性分析》


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注:IgV_H:免疫球蛋白(Ig)的重链(H)可变域(V);IgC_CH1_IgAEGM:α,ε,γ和μ重链的第一个免疫球蛋白恒定域;L1:IgV_H上的高变区1;L2:IgV_H上的高变区2;L3:IgV_H上的高变区3。NCBI Identities(%):相应基因序列在NCBI数据库中的最高相似性。

取外周血淋巴细胞提取总RNA,以反转录的cDNA为模板,PCR扩增VH、VL、Fc片段。结果扩增得到的VH片段约450 bp(图1A),VL片段长度约330 bp(图1B),Fc片段约1 000 bp(图1C)。VH、VL片段经测序后与GenBank上已上传的犬抗体重链可变区(AF354264.1)以及轻链可变区(XM532962.3)序列比对,符合犬抗体可变区序列特征。重叠延伸PCR拼接VH与VL基因片段,获得scFv全长片段,大小约为870 bp(图1C),与预期结果相符。参照文献[12],对获得的11个序列进行分析,其中4个序列不含终止子,且它们之间的核苷酸序列相似性为77.86%。相关特性见表2。综合结构域、同源性以及SWISS‐MODEL软件的比对结果,scFv‐8与数据库中已注释的5yd5.1.A(scFv4B08)的氨基酸序列相似性达到53.01%,且覆盖90%以上,其结果值得信赖[13],是较为理想的候选抗体序列。将scFv‐8与Fc片段相连,构建pET‐32a‐scFv‐Fc重组表达载体片段,在转化感受态后挑取单菌落,并对重组表达载体pET‐32a‐scFv‐Fc进行PCR和测序鉴定,得到1 866 bp大小条带(图1C),其测序结果与预期结果相符,无碱基突变,并符合GenBank上已上传的犬抗体序列(MG787316.1)特征,表明目的基因插入成功。