《表5 scFv-Cry1Aa和scFv-Cry1Ac的氢键和疏水键比较》

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《单链抗体对Cry1A类毒素的检测方法建立及识别差异初步研究》

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以Cry1Ac为例，利用ZDOCK对接程序将scFv分别与Cry1Aa、Cry1Ac的112～131位氨基酸进行分子对接，选取能量最低的对接模型进行Ligplot分析，结果如图8所示，Cry1Aa与scFv的结合模式中，重、轻链中只有少数氨基酸形成氢键和疏水作用（图8A）。而scFv-Cry1Ac复合物中，单链抗体中重、轻链参与结合的氨基酸共同形成氢键和疏水作用，将T2肽段中6个氨基酸紧紧“钳合”在一起，具有牢固的“结构互补”形态（图8B）。对scFv结合氨基酸数目统计，结果显示在Cry1Aa-scFv和Cry1Ac-scFv复合物中，Cry1Ac与scFv结合形成的氢键和疏水作用数目都多于Cry1Aa-scFv，其中Cry1Ac-scFv的疏水作用力数目达到Cry1Aa-scFv的3倍（表5），由此可见，氢键和疏水作用力在结合过程中起主要作用，对结合活性影响巨大。