《表4 关键化学成分与PRKCD形成的氢键及疏水作用》

《表4 关键化学成分与PRKCD形成的氢键及疏水作用》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《广金钱草挥发油基于TRP通道的抗炎作用研究》


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基于Ligplot 1.4.5软件对广金钱草挥发油关键化学成分(Total-Score>50)和TPRV1、PRKCD的相互作用进行分析,结果以氢键、疏水作用和结构比对输出,筛选关键的氨基酸位点。结构比对结果见表3、4,叶绿醇、三十一烷、法尼基丙酮、角鲨烯、2-硬脂酸单甘油酯和1-棕榈酸单甘油酯与TPRV1相互作用有很大的相似性,结构比对中可以看出Lys155、Tyr194、Leu163、Tyr199等氨基酸残基相对位置相同,氨基酸类型相同(表3);同样这些化合物与PRKCD的相互作用有很大的相似性,结构比对中可以看出Ala61、Asp60、Try64、Glu23、Gln8等氨基酸残基相对位置相同,氨基酸类型相同(表4)。可以推测这些残基就是TPRV1和PRKCD的重要残基,其在决定酶的催化特性中起到了重要作用。