《表2 rab7预测靶向序列的相关信息》
提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《dCas9-gRNA在卡介苗侵染小鼠巨噬细胞过程中对rab7的调控作用》
注解:(1)E:有效性评分;(2)NGG错配评分:0mismatch,1mismatch,2mismatches,3mismatches。
rab7 mRNA共2 173 bp(GenBank NM_009005),包含10个外显子。利用在线gCRISPR-ERA设计靶向配对区。根据评分筛选出3条靶向序列(gRNA1、gRNA2、gRNA3),均位于第3外显子,gRNA序列正义链5’端加上BbsⅠ酶切识位点-cacc,反义链5’端加上-aaac。由于rab7-gRNA2存在3个碱基错配的风险,且gRNA3靶向位点距转录起始点(TSS)更近,且gRNA2与gRNA3存在位置接续的关系,故最后选择错配风险较小的gRNA1和gRNA3进行后续实验,见表2。
图表编号 | XD00138770200 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2020.02.20 |
作者 | 郭越、杨文淇、关松磊 |
绘制单位 | 吉林农业大学生命科学学院、吉林农业大学生命科学学院、吉林农业大学生命科学学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |