《表2 荧光定量PCR引物设定》
先采用TMM对read count数据进行标准化处理,再用DEGseq进行差异分析,筛选阈值为Q-value<0.05且|log2FoldChange|>1,且Q-value越小基因表达量差异越显著[17]。在3个样品中共存的差异表达基因中筛选出与铁线莲花芽分化的相关关键基因进行荧光定量PCR验证。用肌动蛋白(actin>Cluster-24019.26582[Sedum alfredii])作为内参基因,用primer5.0设计PCR引物序列,各基因设3次PCR重复检测,利用2^-△△Ct分析基因的相对表达量[18],用超微量核酸蛋白测定仪(scandrop100)检测RNA OD值,A260/A280比值计算RNA纯度。样品RNA检测结果见表1,设定引物序列(5'—3')见表2。
图表编号 | XD00136297000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.01 |
作者 | 熊阳阳、罗琳莉、赵士豪、周安龙、王锦 |
绘制单位 | 西南林业大学园林学院、西南林业大学园林学院、西南林业大学园林学院、西南林业大学园林学院、西南林业大学园林学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |