《表1 拟南芥基因组数据：拟南芥外显子连接序列上最佳匹配片段的偏好》

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《拟南芥外显子连接序列上最佳匹配片段的偏好》

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我们把拟南芥（A.thaliana）基因做为研究样本，在外显子和外显子连接点向前后各取100bp，形成了200bp的外显子连接序列。序列共61565个，其中与第一个内含子序列相对应的外显子连接序列总共14422个（见表1）。研究显示，20bp约为最佳匹配区域的最佳长度，在此范围内还存有边界效应，该效应由外显子连接序列边界上的局部比对所引起。研究表明外显子上游24bp附近存在EJC，所以最佳匹配频率分布可以在-80bp～80bp范围内覆盖EJC区域。