《表3 与核心基因相关的前15个转录因子》

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《DGKZ基因沉默条件下人骨肉瘤细胞芯片的生物信息学分析》

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STRING数据库用来对DEGs做PPI网络分析，分析结果在Cytoscape软件中进行可视化（见图5）。随后使用cytoHubba插件计算PPI网络拓扑结构中节点的度值，将度值前10的基因视为核心基因，分别有SIRT1、EP300、PTGS2、BMP2、HIF1A、RB1、HIST1H2BO、NT5E、H1F0、HIST1H2AC，见图6。核心基因通过iRegulon插件预测转录因子，前15个转录因子见表3。对NES最高的转录因子YY1进行靶基因预测，预测得到的靶基因有EP300、H1F0、BMP2以及HIF1A。