《表1 与Hub基因相关的前15位转录因子 (NES>3)》
运用生物信息分析学软件Cytoscape(3.4.0版本)中的iRegulon插件预测DEGs中Hub基因的转录因子,并分析这些转录因子所调节的DEGs[12]。发现与CXCR4、SELL、CD79A、MMP3、CD68、ADIPOQ、CCL19、IL-7R、IL-1β、MYH14、APOE和FCGR3A等相关的转录因子有BCL3、POLR2A、FOXJ1、GFI1、NR1H2、FOXN4、KLF16、AR、FOS、SRF、IRF4、TGIF1、GATA3、RCOR1、JUND、PBX3、NFATC1、ATF3、IRF8、SOX10、SIN3A、EGR1、ETS1、EVX2、CFL2、MTA3、IRF1、MYLK、MYF5、BCL6、POU2F2、GLI3、BCLAF1、PRKAA2、STAT5A、TCF12、ATF2、ARID3A、E2F1、PML和BRF2等41个。部分结果见表1。部分Hub基因相关转录因子的靶基因作用关系见图5。
图表编号 | XD0030315100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.15 |
作者 | 张东亮、赵舒煊、向高、刘开鑫、巩朝阳、王拴科、张海鸿 |
绘制单位 | 兰州大学第二医院骨科、甘肃省骨关节疾病研究重点实验室、兰州大学第二医院骨科、甘肃省骨关节疾病研究重点实验室、兰州大学第二医院骨科、甘肃省骨关节疾病研究重点实验室、兰州大学第二医院骨科、甘肃省骨关节疾病研究重点实验室、兰州大学第二医院骨科、甘肃省骨关节疾病研究重点实验室、兰州大学第二医院骨科、甘肃省骨关节疾病研究重点实验室、兰州大学第二医院骨科 |
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