《表1 候选基因名称及定量引物序列》

《表1 候选基因名称及定量引物序列》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《干旱胁迫和复水处理下玉米差异表达转录因子基因分析》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录
MYB:禽成髓细胞性白血病病毒癌基因同源物;bHLH:碱性螺旋-环-螺旋;ZFP:锌指结构蛋白;Hb:同源异型盒;下同

结合转录组数据的初步分析结果,筛选出与玉米干旱胁迫及复水相关的差异表达转录因子基因共9个,验证转录组测序结果的可靠性。依据候选基因ID(Ensemblplants,http://plants.ensembl.org/index.html)(详见表1)从玉米数据库(http://www.maizesequence.org/index.html)中检索得到对应的cDNA序列,利用Primer Premier 5.0软件进行引物设计,引物序列见表1。每个样品的RNA利用FastQuantcDNA第一链合成试剂盒(天根公司,北京)合成c D-NA。以玉米18S RNA为内参基因(GenBank No.AF168884.1),利用CFX96实时荧光定量PCR仪(Bio-Rad,美国),参考SYBR Premix Ex TaqTM(TaKaRa,大连)试剂盒说明书,反应在Bio-red CFX96荧光定量PCR仪上运行,PCR反应体系为20μL,SYBR Green Premix Ex TaqⅡ10μL,上、下游引物(10μmol/L)各1μL,cDNA 1μL,ddH2O 7μL。反应程序:95℃30 s;95℃15 s,60℃30 s,40个循环。根据2-ΔΔCt法(Livak,Schmittgen,2001)计算基因的相对表达量,每个基因的定量设置3个生物学重复,计算标准差。