《表1 引物列表:两个糙皮侧耳菌株的比较基因组学研究》

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《两个糙皮侧耳菌株的比较基因组学研究》


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将长度大于50kb的插入/缺失定义为大片段的遗传变异,根据1.3得到的位置信息,截取In/Del断点及上下游各2kb侧翼序列,使用MEGA6.0(Tamura et al.2013)进行序列比对。使用Primer Premier 6设计引物,以测序单核菌株CCMSSC00389-1和CCMSSC03989-1基因组DNA为模板,扩增断点及侧翼序列,并进行一代测序,引物序列见表1。