《表1 雷蒙德氏棉中MAPKKK基因家族信息》
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《雷蒙德氏棉MAPKKK基因家族全基因组筛选及其同源基因在陆地棉中表达分析》
从雷蒙德氏棉全基因组中鉴定到114个MAPKKK基因家族成员(表1)。通过SMART及PFam工具进行蛋白质结构分析,114个雷蒙德氏棉MAPKKK蛋白均含有保守的蛋白激酶结构域。通过ExPASy工具,对雷蒙德氏棉MAPKKK基因进行了相对分子质量、等电点及亚细胞定位等生化属性分析,最长的雷蒙德氏棉MAPKKK蛋白GrRaf44包含1 403个氨基酸残基,最短的GrZIK1蛋白仅有296个氨基酸残基,它们的相对分子质量在33.82 kDa(GrZIK7)到151.51 kDa(GrRaf44)之间,等电点分布在4.65(GrMEKK2)到9.43(GrRaf48)之间(表1)。根据WoLFPSORT预测的亚细胞定位结果(表1),61个MAPKKK蛋白定位到细胞核中(占到总数的53.51%),有可能参与某些基因转录的调控;定位在细胞质和叶绿体的分别有25和21个,分别占总数的21.93%和18.42%;定位在线粒体、细胞膜、细胞骨架、内质网中的总共有7个,占总数的6.14%。
图表编号 | XD00109175700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.11.15 |
作者 | 许好标、李黎贝、张驰、冯震、喻树迅 |
绘制单位 | 浙江农林大学、省部共建亚热带森林培育国家重点实验室、中国农业科学院棉花研究所、棉花生物学国家重点实验室、中国农业科学院棉花研究所、棉花生物学国家重点实验室、浙江农林大学、省部共建亚热带森林培育国家重点实验室、浙江农林大学、省部共建亚热带森林培育国家重点实验室、中国农业科学院棉花研究所、棉花生物学国家重点实验室 |
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