《表2 2个雷蒙德氏棉基因组数据库中共有的MAPKKK基因》

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《雷蒙德氏棉MAPKKK基因家族全基因组筛选及其同源基因在陆地棉中表达分析》


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注:括号外是利用Paterson等[27]发表的雷蒙德氏棉基因组库发掘的MAPKKK基因名称;括号内是Yin等[11]利用Wang等[26]发表的雷蒙德氏棉基因组库发掘的MAPKKK基因名称。

Yin等[11]利用Wang等[26]发表的雷蒙德氏棉基因组数据库,发掘了78个MAPKKK家族基因(图6中的Ⅰ+Ⅱ);本研究利用Paterson等[27]发布的雷蒙德氏棉基因组数据库,发掘了114个MAPKKK家族基因(图6中的Ⅱ+Ⅲ)。利用本地Blastp对2个数据库新发掘的MAPKKK基因序列进行比对,其中47个基因序列(图6中的Ⅱ)相似度达到了100%,说明在2个雷蒙德氏棉基因组数据库共同发掘到了47个序列完全相同的MAPKKK基因,另外98个MAPKKK基因序列(图6中的Ⅰ+Ⅲ)之间存在差异。这47个共有MAPKKK基因分布在Raf(24个)、ZIK(10个)和MEKK(13个)3个类群中(表2)。